Se desconoce la etiología o el origen de la fibromialgia, pero los expertos apuntan que se desencadena por causas multifactoriales, ninguna de ellas es determinantes ni específicas.

Hay personas que desarrollan la dolencia sin motivo aparente. Otras, inician los síntomas después de sufrir una infección vírica, accidente, alteraciones hormonales, etc., y en otras, aparece al tiempo de sufrir alguna dolencia de tipo invalidante como la artritis reumatoide, lupus eritematoso, etc.

Entre los factores desencadenantes estudiados hay factores genéticos, psicosociales, bioquímicos y inmunohormonales: infecciones bacterianas o por virus neurotropos, traumas psíquicos o físicos, posibles genes, factores psicológicos (ansiedad, depresión…), intervenciones quirúrgicas, neuralgias, alteraciones posturales, metabólicas, carencias nutricionales, alteraciones inmunológicas, cambios hormonales, alteraciones de ciertas sustancias químicas como la serotonina, la sustancia P, relacionadas con los mecanismos de transmisión y amplificación de la sensación de dolor.

No significa que estos factores por si mismos causen la dolencia si no que, si están y concurre alguno de estos factores desencadenantes, podría acontecer la afección.

Según la Guía de la Fibromialgia, de CatSalut (febrero, 2010), «en la FM, el dolor parece causado por una combinación de procesos nociceptivos centrales y psicológicos que disminuyen el umbral y la tolerancia.».

Aun así, todo y los estudios no existen resultados concluyentes y la mayoría son contradictorios.